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吉林经开区深入实施省委、省政府提出的创新驱动发展战略，加大科技创新力度，努力培育内生动力，转型升级取得积极成果。
着力推动创新要素聚集。对高科技项目实施“靶向招商”，紧紧围绕精细化工、生物、碳纤维、化学原料药、节能环保等新兴产业，面向国内领先、国际前沿、行业高端开展招商，精心引进一批投资规模大、科技含量高、创税能力强、环保效果好的战略性新兴产业，带动结构优化升级。目前，已经拥有高新技术企业7家，战略性新兴产业企业38家，其中产值超亿元科技企业27家，产值超10亿元企业3家。2015年底，各类科技企业产值实现200亿元，占规模工业产值的60%。
持续提高自主创新能力。建立了以企业为主体、政府为引导、金融为支撑、民间为补充的科技创新投融资机制。目前共承担国家和省、市科技发展计划项目近200项，共取得科技成果108项，其中达到国际领先水平8项，国际先进水平7项，国内领先水平43项，国内先进水平50项。核心技术获得发明专利授权35项，实用新型专利授权58项，获得市级以上科技进步奖57项。
建立产学研发展战略联盟。充分发挥开发区主导作用，帮助康乃尔化工、正业生物、普瑞特生物等行业骨干企业与科研院所和高等院校加强科技合作。目前已与中科院一院五所、清华大学、吉林大学等12所知名高校、科研单位建立紧密型合作关系，区内62家企业与国内24家高校、院所建立合作关系，共签订产学研合作意向67项。鼓励有条件的企业积极加入相关领域战略联盟，瞄准产业发展重大科技需求开展科技攻关。推动开发区企业“抱团创新”和产业升级，在重点领域实现集群化、规模化发展。
